يعين مدير عام للمركز -بقرار من المجلس- ويحدد القرار اجره ومزاياه المالية الاخرى، ويكون المسؤول التنفيذي عن ادارة المركز، وتتركز مسؤولياته في حدود ما ينص عليه التنظيم، وما يقرره المجلس، ويمارس الاختصاصات الاتية: 1- اقتراح خطط المركز وبرامجه، والاشراف على تنفيذها بعد موافقة المجلس. 2- اقتراح اللوائح اللازمة لتسيير العمل في المركز، وتحديد اجراءات العمل المبنية على السياسات واللوائح والقرارات الصادرة من المجلس. 3- اقتراح معايير الجودة في مجال التعليم الالكتروني وضوابطها، تمهيدا لعرضها على المجلس. 4- اقتراح ضوابط الترخيص والتاهيل لبرامج التعليم الالكتروني؛ تمهيدا لعرضها على المجلس. 5- اقتراح هيكل المركز التنظيمي، ولوائحه المالية والادارية، وعرضها على المجلس, والاشراف على تنفيذها بعد اقرارها. 6- الاشراف على اعداد تقرير المركز السنوي ومشروع ميزانيته وحسابه الختامي؛ تمهيدا لعرضها على المجلس. 7- الصرف من ميزانية المركز، واتخاذ جميع الاجراءات المالية، وفقا للانظمة واللوائح، وفي حدود الصلاحيات التي فوضه بها المجلس. 8- تقديم تقارير دورية الى المجلس عن اعمال المركز ومنجزاته ونشاطاته. 9- تعيين منسوبي المركز وفقا للوائح المنظمة لذلك, والاشراف عليهم طبقا للصلاحيات الممنوحة له وما تحدده لوائح المركز. 10- متابعة تنفيذ قرارات المجلس. 11- اقتراح سياسة الاستثمار المالي للمركز؛ تمهيدا لعرضها على المجلس. 12- التوقيع على الاتفاقيات والعقود بعد موافقة المجلس, ووفقا للاجراءات النظامية المتبعة. 13- تمثيل المركز امام القضاء، ولدى الجهات الحكومية والمؤسسات والهيئات الاخرى ذات العلاقة، وغيرها من الجهات داخل المملكة وخارجها. ولمدير المركز تفويض بعض اختصاصاته الى من يراه من منسوبي المركز.