يجوز للهيئة الاتفاق على تسوية اي نزاع او خلاف ينشا بينها وبين المرخص له عن طريق التحكيم، وفقا لنظام التحكيم في المملكة. يصدر المجلس، بعد التنسيق مع وزارة الصناعة والثروة المعدنية، اللائحة خلال (تسعين) يوما من تاريخ نشر النظام في الجريدة الرسمية.