تراعى المبادئ الاتية عند تطبيق احكام النظام: عدم التمييز بين المنتجات المحلية والمستوردة، التي توضع او تعرض في الاسواق، فيما يتصل بالالزام باللوائح الفنية. تناسب المتطلبات والاجراءات التصحيحية والعقوبات التي تقرر وفقا للنظام مع شدة الخطر وخطورة المخالفة. التنسيق الفعال والتعاون بين جميع الجهات ذات العلاقة بتطبيق النظام. الشفافية في تطبيق احكام النظام، واشراك جميع اصحاب المصالح.