للهيئة -اضافة الى اختصاصاتها المقررة نظاما- ودون اخلال باختصاصات الجهات الحكومية ذات العلاقة، اتخاذ ما يلزم في سبيل تحقيق اهدافها، ولها على وجه خاص ما ياتي: 1- وضع السياسة العامة والخطط والبرامج اللازمة لعمل الهيئة. 2- توظيف التقنية الحديثة في تنفيذ اعمال الهيئة ومراقبتها وتسهيلها، وفي تعزيز الدور الامني في مكافحة التهريب الجمركي. 3- التعاون مع القطاع الخاص في شان تنفيذ بعض الاعمال المساندة، وادارتها. 4- وضع الخطط اللازمة؛ لتنظيم مرافق المنافذ الجمركية وادارتها واستثمارها. 5- وضع معايير لمتابعة مؤشرات اداء اعمال الهيئة وخططها, التي تكفل تطوير ادائها وخدماتها, وللهيئة التنسيق في هذا الشان مع من تراه من الجهات ذات الصلة باختصاصها. 6- تمثيل المملكة في المنظمات والهيئات والمحافل والمؤتمرات الاقليمية والدولية ذات الصلة باختصاصات الهيئة. 7- التعاون وتبادل الخبرات مع المنظمات والهيئات الاقليمية والدولية، وبيوت الخبرة المتخصصة داخل المملكة وخارجها، وذلك في حدود اختصاصات الهيئة.