تهدف الهيئة الى حماية الصحة العامة وتعزيزها، والوقاية من التعرض للاصابة بالامراض -المعدية وغير المعدية- ورفع الجاهزية العامة للاستجابة لطوارئ الصحة العامة، وتنظيم الجهود بين الجهات ذات العلاقة، وفقا للنصوص النظامية ذات الصلة.