يهدف الصندوق الى الاسهام في تحقيق الاستراتيجية الوطنية للبيئة والاستدامة المالية للمراكز الوطنية لقطاعي البيئة والارصاد، وتمكينها من مباشرة مهماتها ومسؤولياتها وفق الانظمة ذات العلاقة وتنظيم كل مركز.