يرتبط المركز تنظيميا بالمجلس، ويتصل بشبكة الية للمعلومات الصحية مع وزارة الصحة والخدمات الطبية في الاجهزة العسكرية والمستشفيات الجامعية، وغيرها من الاجهزة الحكومية والخاصة ذات العلاقة، ويكون مقر المركز مدينة الرياض، وله ان ينشئ فروعا داخل المملكة.