يكون للمجلس الاعلى امانة عامة، ويعين الامين العام والموظفين اللازمون وفقا لانظمة الخدمة المدنية، ويتولى الامين العام ما ياتي: ا - ادارة اعمال الامانة. ب - امانة سر المجلس، والتحضير لاجتماعاته، وتسجيل محاضره، وتبليغ قراراته للجهات المعنية. ج - اعداد اللوائح التنفيذية لهذا النظام. د - اعداد الدراسات الفنية التي يتطلبها عمل المجلس. ه - اعداد مشروعات الانظمة واللوائح المتعلقة بشؤون المعوقين، بالتنسيق مع الجهات المعنية. و - اعداد مشروع ميزانية المجلس . ز - تمثيل المجلس لدى الجهات الحكومية والمؤسسات والهيئات الاخرى ذات العلاقة. ح - تكوين لجان من الخبراء والمختصين لدراسة ما يراه من امور ذات صلة بشؤون المعوقين. ط - اعداد التقرير السنوي عن اعمال المجلس . ي - اي اعمال اخرى يكلفه بها المجلس.